Describen la secuencia genómica completa del Trypanosoma cruzi Ikiakora (TcIIII)

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Un trabajo colaborativo de la RICET describe por primera vez la secuencia genómica completa del Trypanosoma cruzi Ikiakora (TcIIII). El trabajo reporta el genoma de la cepa Ikiakarora de Trypanosoma cruzi, protozoo causante de la enfermedad de Chagas  y responsable de más de 10.000 muertes anuales en latino América. T. cruzi presenta un alto nivel de variabilidad genética,  siendo tipificado en 6 unidades  discretas (DTUs), e Ikiakarora pertenece al DTU III el más común en America del Sur. La cepa  fue aislada en Catatumbo (Norte de Santander, Colombia) procedente del vector selvático Rhodnius prolixus, el segundo más frecuente en la transmisión de la enfermedad de Chagas.  El trabajo, relevante por el potencial que representa para el estudio de genes y secuencias reguladoras de alto interés biológico, describe la secuenciación del genoma de dicha cepa así como su ensamblaje, aportando los principales parámetros del genoma ensamblado y detallando la metodología seguida.

Los datos completos de esta secuenciación genómica se encuentran disponibles en GenBank (número de acceso: WWPZ00000000), así como las lecturas en Sequence Read Archive (SRA) (números de acceso: SRR11235102SRR11235103 y SRR11235104), BioProject (PRJNA595095). El análisis de la integridad del ensamblaje muestra un total de 106 BUSCOs completos (81,6%) y 102 BUSCOs de copia única (78,5%).

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